Éloigné de tout, le manoir de Charles Xavier est l'endroit parfait pour accueillir les jeunes mutants afin qu'ils développent au mieux leurs capacités. L'école se situe dans le comté de Westchester (New-York) et est entourée de boisements. Un grand parc s'étend tout autour de l'institut, laissant le loisir aux élèves de se détendre à l'extérieur.

Le rez-de-chaussée possède de nombreuses pièces - même des pièces secrètes. Ici, vous trouverez les salles de cours et de détente mais aussi des pièces à vivre comme la cuisine et le salon où se trouve un petit poste de télévision.

Le premier étage regroupe plusieurs chambres d'étudiants. Les chambres des filles se trouvent à gauche du manoir, celles des garçons à droite. Au centre se trouvent la chambre du professeur Xavier ainsi qu'une salle de laverie pour les vêtements.

Au second étage, on peut retrouver les chambres - individuelles - des professeurs ou des adultes logeant à l’institut. Il n'y a pour l'instant aucune autre pièce à part une salle de laverie pour tous les adultes.

Au premier sous-sol se trouve de nombreuses pièces d’entraînements pour les mutants mais également une piscine pour le sport ou la détente, ainsi que de nombreux laboratoires pour les scientifiques.

Le second sous-sol a été conçu en premier lieu pour protéger les occupants du manoir des attaques nucléaires au cas où un événement catastrophique venait à se produire. Un bunker est donc mis à la disposition des mutants qui ont une capacité particulière et dangereuse pour autrui si elle est mal utilisée.